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Cita de: Lurker en Agosto 20, 2020, 10:43:16 am(...) PERO, las PCRs tienen más problemas asociados:-La contaminación inherente, una purificación y aislamiento inadecuados conducen a resultados erróneos-Personal altamente cualificado y laboratorios del mismo nivel-La técnica conlleva problemas de reproducibilidad y fiabilidad(fuente: Instituto Nacional de Nanociencia y Nanotecnología (ICN2), CSIC, CIBER-BBN y BIST Bellaterra, BCN)Opinión de alguien que no es del sector sanitario. Me tocó colaborar un par de meses en, digamos, el desarrollo e implantación de una solución con open-hardware para ayudar en una semi-automatización de la preparación de los test PCR, y me quedaron claras varias cosas que se alinean con lo que dice el forero Lurker...Para preparar un conjunto de test PCR para un número de, digamos varias docenas de pacientes, participan varias personas de cualificación relevante. O bien microbiólogos directamente, o personal técnico de laboratorio habituado a trabajar pipeteando reactivos con precisión y manejando los distintos aparatos de laboratorio implicados en el proceso (robots de extracción, termocicladoras, agitador, campana para inactivar las muestras, etc). Se gasta mucho material. Esto apenas lo he visto comentar, pero en los hospitales donde estuve (y no hablamos de Madrid) es una preocupación diaria (me consta que lo sigue siendo a día de hoy, como ya nos explicaron que sucedería pues es el contexto actual). Los reactivos de los fabricantes tienen problemas de distribución, y tampoco sobran elementos fungibles como tubitos para las muestras y los reactivos (anécdota personal: un día que dijimos en un hospital en el que estábamos empezando a hacer pruebas, que nos vendría bien una bolsa de 100 tubitos para experimentar con el calibrado y la programación, se llevaron las manos a la cabeza diciendo "uy uy, ¡pero si no tenemos tantos ni para nosotros!").El proceso de preparar un conjunto de tests lleva tiempo, y estoy hablando en la escala de 3 o 4 horas. Hay varios puntos que son cuellos de botella. No es sólo el factor humano, también las máquinas tienen una capacidad física limitada en número de muestras a procesar. Y hay un número no pequeño de pasos que requieren un tiempo X y no se pueden saltar ni abreviar más allá de un límite razonable sin sacrificar sensibilidad. Por cierto, que es por esto por lo que las técnicas de screening vienen tan bien. Se parte de la base de que se está actuando con una población de reducido porcentaje de contagiados, y se procesan "pooles" de muestras en vez de muestras de pacientes individuales. Luego donde hay positivos, se procede uno por uno. Efectuado de forma totalmente manual, es MUY propenso al error puesto que es una labor muy muy repetitiva, pero al mismo tiempo varios pasos del proceso requieren una precisión muy elevada. Por tanto, los técnicos de laboratorio tienen que hacer un esfuerzo importante por mantener la concentración y no cometer errores, sobre todo al pipetear. Esto genera cansancio rápidamente, como se puede uno imaginar.Hay distintos fabricantes de tests, cada uno con sus reactivos y su "receta" de cómo preparar el test. Y digo receta porque esto funciona como una receta de cocina exageradamente elaborada donde hay muchísimos pasos de pipetear reactivos, se usan herramientas como un agitador o un imán para atraer unas partículas, hay tiempos de espera a temperatura ambiente, hay otros tiempos durante los cuales es preciso calentar los reactivos a determinada temperatura, etc. Para afinar todo este proceso, independientemente del grado de automatización, hay una labor de ensayo y error para conseguir mejores resultados de sensibilidad. Esto no es una ciencia exacta, y distintos microbiólogos tienen criterios diferentes sobre cómo interpretar los protocolos de cada fabricante (incluso sobre qué fabricante les parece más fiable, aunque en mi breve experiencia a ese respecto había bastante consenso), y cómo emplearlos con mayor eficacia. Esta labor, es altamente especializada. También podría hacer comentarios sobre cómo determinados actores intermedios están intentando explotar el nuevo filón de la industria del covid y se comportan con muy escasa profesionalidad que roza o supera la negligencia, cuando el personal de los laboratorios que he conocido (gente extraordinariamente competente y con mucha voluntad) resuelve su trabajo mientras hacen el pino-puente y apagan fuegos casi a diario. Pero debo guardar una cierta discreción en este relato, no vaya a ser.
(...) PERO, las PCRs tienen más problemas asociados:-La contaminación inherente, una purificación y aislamiento inadecuados conducen a resultados erróneos-Personal altamente cualificado y laboratorios del mismo nivel-La técnica conlleva problemas de reproducibilidad y fiabilidad(fuente: Instituto Nacional de Nanociencia y Nanotecnología (ICN2), CSIC, CIBER-BBN y BIST Bellaterra, BCN)
Opinión de alguien que no es del sector sanitario. Me tocó colaborar un par de meses en, digamos, el desarrollo e implantación de una solución con open-hardware para ayudar en una semi-automatización de la preparación de los test PCR, y me quedaron claras varias cosas que se alinean con lo que dice el forero Lurker...Para preparar un conjunto de test PCR para un número de, digamos varias docenas de pacientes, participan varias personas de cualificación relevante. O bien microbiólogos directamente, o personal técnico de laboratorio habituado a trabajar pipeteando reactivos con precisión y manejando los distintos aparatos de laboratorio implicados en el proceso (robots de extracción, termocicladoras, agitador, campana para inactivar las muestras, etc).[...]
https://www.standard.co.uk/news/uk/matt-hancock-no-reason-not-to-go-back-to-work-coronavirus-a4528871.htmlMatt Hancock insists no reason not to go back to work as 'little evidence' coronavirus is passed on in officesMatt Hancock: "La transmisión está ocurriendo en LOS HOGARES."
"The virus needs to be taken into homes by someone and they will have had to pick it up from somewhere else. Therefore, even a single workplace transmission could lead to multiple onward infections in a family, household or other setting."
COVID fatigueWorldwide search interest in COVID-19 is at levels far below its previous peak
[...] A través de una simulación por ordenador, simularon los flujos de agua y aire en un váter y la nube de gotas que se producen al tirar de la cadena. Para ello, utilizaron un conjunto de fórmulas dinámicas de fluidos -conocidas como las ecuaciones de Navier-Stokes-, para simular la descarga en dos tipos de inodoros: uno con una sola entrada para descargar agua y otro con dos entradas para crear un flujo rotativo.
Así, Macron no ha descartado que algunas zonas puedan volver a confinarse "si la situación lo requiere", pero ha descartado un paso similar como el dado en marzo. "No podemos parar el país porque los daños colaterales de un confinamiento son considerables", ha advertido.
Cita de: lum en Agosto 20, 2020, 11:56:23 amOpinión de alguien que no es del sector sanitario. Me tocó colaborar un par de meses en, digamos, el desarrollo e implantación de una solución con open-hardware para ayudar en una semi-automatización de la preparación de los test PCR, y me quedaron claras varias cosas que se alinean con lo que dice el forero Lurker...Para preparar un conjunto de test PCR para un número de, digamos varias docenas de pacientes, participan varias personas de cualificación relevante. O bien microbiólogos directamente, o personal técnico de laboratorio habituado a trabajar pipeteando reactivos con precisión y manejando los distintos aparatos de laboratorio implicados en el proceso (robots de extracción, termocicladoras, agitador, campana para inactivar las muestras, etc).[...]Buen post explicando lo que para los que nos hemos dedicado a esto es evidente, pero no a los que nunca se han acercado a nuestro mundillo Pero dicho todo esto... la PCR es una técnica de rutina en TODOS los laboratorios de biología molecular. Y lo creáis o no hay bastantes en cuanto juntas hospitales, OPIs, universidades y el sector privado.Los cuellos de botella en esta historia han sido los gestores, la situación laboral esperpéntica de los únicos que pueden acometer este reto y en un momento inicial, el número de "manos". Ahora mismo hay cosas tan chulas como esto:https://opentrons.com/Que han sido puestas a punto por esta gente del ISCIII: https://github.com/BU-ISCIII/opentrons_covid19Sí, estimados colegas. Se han tenido que currar ellos mismos el código del robot.Conozco a quiénes están detrás de esto y son unos cracks con unas condiciones laborales insultantes. Cada dos años por decreto tienen que echar al personal de esos laboratorios porque no pueden encadenar contratos temporales. La única manera que tienen para afianzar equipos es sacarse una oposición cuando sea que salgan. Casi nada.Que nos quede claro a todos: quienes en última instancia nos está salvando el culo, son unos currelas laboralmente maltratados del mundo sanitario y del I+D(+i). Unos tipos que van a ser los primeros despedidos en cuanto empiecen los recortes. Siempre ha sido así y no dudo de que la sociedad española volverá a pagar con esta moneda a quienes tanto le han dado.Saludos.
El gobierno anunció hoy la ampliación del uso de máscaras en sueños realizados entre las 10 p.m. y las 7 a.m., hora de París.Una medida a la que se suma la obligación de realizar los gestos de barrera dentro de dichos sueños y de disponer de una cantidad suficiente de gel hidroalcohólico a disposición de todas las quimeras presentes en el sueño. "Básicamente, si sueño con Natalie Portman mañana, ¿tengo que quedarme a más de dos metros de ella?" genial, gracias, genial, de verdad vale la pena soñar ” lamenta Jérémy, de 28 años. Una medida considerada muy restrictiva por varios durmientes que creen que atenta contra su libertad individual. " Con qué derecho viene el gobierno a decirme qué ponerme o no ponerme en mis sueños" explica Damien quien de repente se dio cuenta de que no llevaba pantalones en la calle, un sueño que tiene recurrente. Las autoridades están preocupadas por la cantidad de clusteres en varios sueños y el riesgo de posible confinamiento en los sueños. "Se podría exigir que las personas ya no puedan ir a esta o aquella zona de la corteza que pertenece al sueño profundo". analiza un portavoz del Primer Ministro montado en un dragón con la cara de Emmanuel Macron. Las autoridades podrían establecer comités de vigilancia que inspeccionarían las diferentes capas de los sueños, y los delincuentes se verían obligados a soñar que constantemente repasan el mismo examen.
El Juzgado de lo Contencioso-Administrativo número dos de Madrid ha anulado la orden de la Comunidad que prohíbe fumar en la calle, espacios públicos y terrazas si no se mantiene la distancia de seguridad para evitar la propagación del coronavirus, así como el cierre de discotecas y otros locales de ocio nocturno.....Madrid pidió la ratificación de la ordenAsimismo, el juez mantiene que un Gobierno autonómico, en este caso liderado porIsabel Díaz Ayuso, no puede limitar derechos fundamentales de los ciudadanos "con carácter general" si no se declara previamente un estado de alarma. La propia Comunidad de Madrid presentó un escrito en el que pedía la ratificación de la orden 1008/2020 del pasado día 18 de agosto. En ella, se incluían "medidas preventivas para hacer frente a la crisis sanitaria" una vez finalizada la prórroga del estado de alarma.Entre ellas, el Real Decreto establecía que se debían reforzar los controles para impedir el consumo de alcohol en la vía pública, lo conocido como 'botellón', así como el obligatorio uso de mascarillas al aire libre, en espacios cerrados y en los transportes públicos cuando no se respetase la distancia de seguridad. El día 14 el Ministerio de Sanidad acordó con las comunidades la prohibición de fumar en la calle y el cierre de locales de ocio nocturnoAdemás de estas, se estableció que las reuniones en la calle (y en terrazas) debían tener un máximo de diez personas y se establecieron medidas para las residencias de personas mayores en relación a las salidas y visitas a los residentes y realización de pruebas PCR.Orden del Ministerio de SanidadEl pasado día 14, y después de que varias comunidades autónomas lo estableciesen, el Ministerio de Sanidad acordó con las regiones la prohibición de fumar en la calle -siempre que no sea posible mantener la distancia de seguridad- y decretar el cierre de las discotecas y locales de ocio nocturno a partir de la 1.00 de la madrugada en toda EspañaEl magistrado atribuye esta decisión a que esta restricción hace referencia a una orden del Ministerio de Sanidad que no ha sido publicada en el Boletín Oficial del Estado (BOE).Por este motivo, el juez suspende la norma al considerar que limita los derechos fundamentales y no se ha decretado el estado de alarma.
[...]Comentar también que lo de encadenar contratos temporales para los técnicos de laboratorio es algo que se hacía antes, hasta que los trabajadores empezaron a demandar y los tribunales determinaron que había que hacer fija a esa gente. Eso trastocó los presupuestos de algún organismo, que lo que hizo fue repercutir el coste bajando el presupuesto a los centros, "castigando" más a aquellos centros que habían tenido más personal en esa situación (aunque de esto hace tiempo y no recuerdo todos los detalles).
Cita de: Danny_M en Agosto 21, 2020, 01:00:58 am[...]Comentar también que lo de encadenar contratos temporales para los técnicos de laboratorio es algo que se hacía antes, hasta que los trabajadores empezaron a demandar y los tribunales determinaron que había que hacer fija a esa gente. Eso trastocó los presupuestos de algún organismo, que lo que hizo fue repercutir el coste bajando el presupuesto a los centros, "castigando" más a aquellos centros que habían tenido más personal en esa situación (aunque de esto hace tiempo y no recuerdo todos los detalles).No sólo técnicos de laboratorio, sino también investigadores principales que dirigen un laboratorio.Imagínate que estás casi en los cincuenta firmando contratos de 12 meses, con prórrogas de 6. Mientras, eres el responsable de la ejecución de dos proyectos FIS de 250k cada uno, de la coordinación de una RETIC, el que está al frente del proceso de varias patentes en tu centro y coordinas un servicio/unidad de investigación. Yo conozco a varias personas así. ¿Eso es normal? No. No lo es.Al principio de esta crisis se "agilizaron" los procesos de contratación y de estabilización del sector I+D sanitario porque casos como el descrito estaban generalizados. Lo de las comillas viene a que ahora tardaron N-semanas en poner a la burocracia en funcionamiento. A mí, una vez me entrevistaron y me presentaron como candidato a un puesto a través de concurso público y no se resolvió la convocatoria hasta 11 meses después. Como es obvio, ya me había buscado la vida por mi cuenta y no firmé ese contrato.Así son los tiempos y las condiciones del I+D. Y después nos sorprendemos de lo que estamos viviendo. Lo que sucede es algo absolutamente normal, dadas las circunstancias.PD. Ah Danny... no los hacen "fijos". Los hacen "indefinidos". Es muy diferente.